ПЦР тест на коронавирус, ответы на популярные вопросы.

COVID-19 (SARS-CoV-2) продолжает распространяться по миру, а диагностические лаборатории сталкиваются с беспрецедентным спросом на тестирование. ПЦР тест на коронавирус широко используется для первичной диагностики COVID-19, но насколько это оправдано при коронавирусе.

Что такое ПЦР тест

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) используется для идентификации возбудителя инфекции путем сравнения ДНК искомого микроорганизма с эталонной ДНК в исследуемой пробе.

ПЦР тесты относятся к категории экспресс тестов и имеют ориентировочное значение и не являются окончательным диагнозом. Тест выявляет минимальное количество нуклеиновых кислот (РНК) патогенного возбудителя в различных биологических жидкостях и клеточных элементах. В каждом из множества циклов теста происходит амплификация РНК и любые мельчайшие частицы превращаются в ДНК цепочки.

Амплификация — процесс образования дополнительных копий участков хромосомной ДНК, как правило, содержащих определённые гены либо сегменты структурного гетерохроматина. Википедия

Какой должен быть тест

Тесты на наличие инфекции должны обладать тремя качествами: высокой скоростью обнаружения, высокой чувствительностью и специфичностью.

Скорость обнаружения нужна для быстрого исследования. Получать результат в разгар болезни — потерять время на лечение.

Чувствительность определяет количество истинно больных лиц в обследуемой группе. Чем выше чувствительность, тем выше ценность отрицательного результата, т.е. возрастает уверенность в том, что отрицательные результаты можно обнаружить только среди здоровых лиц.

Специфичность определяется количеством истинно здоровых лиц в обследуемой группе. Чем выше специфичность, тем выше ценность положительного результата. Т.е. тем выше уверенность в том, что положительный результат обнаруживают только у больных.

Наибольшую ценность имеют тесты, обладающие одновременно и высокой чувствительностью, и высокой специфичностью. Однако такое соотношение достаточно редко, и попытки повысить специфичность обычно ведут к снижению чувствительности, а увеличение чувствительности влечёт за собой снижение специфичности.

ПЦР тест на коронавирусы

Обнаружение нуклеиновых кислот методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) считается «золотым стандартом» для обнаружения некоторых вирусов и отличается быстрым обнаружением, высокой чувствительностью и специфичностью.

С помощью этого метода ученые могут увидеть результаты еще в процессе исследования. При применении обычной ОТ-ПЦР результаты доступны только после его завершения. Тест обладает достаточной чувствительностью для ранней диагностики инфекции и используется как основной метод для обнаружения коронавируса.

Это связано со специфичностью тест-систем. В России зарегистрированы тест-системы, которые настроены на поиск определенного генома вируса SARS-CoV-2. В то же время, при отрицательном результате, стоит о задуматься о возможности заражения каким-либо другим вирусом.

Специфичность и точность тестов такие же важные характеристики тестов на антитела.

Ложноположительные и ложноотрицательные результаты ПЦР тестов

Проблема ОТ-ПЦР в реальном времени ― риск получения ложноотрицательных и ложноположительных результатов. Многие «подозреваемые» случаи с типичными клиническими характеристиками COVID-19 и идентичными специфическими изображениями компьютерной томографии (КТ) не были подтверждены ПЦР тестированием.

Ложноотрицательные результаты

Ложноотрицательные результаты могут быть получены также из-за мутаций в геноме SARS-CoV-2. Попытка разработать анализ ОТ-ПЦР в реальном времени как можно точнее, может привести к снижению эффективности анализа и потенциальному ложным отрицательным результатам. Несколько типов наборов для ОТ-ПЦР в реальном времени SARS-CoV-2 были разработаны и быстро одобрены, но с разным качеством.

Чувствительность и специфичность самого качественного теста ОТ-ПЦР в реальном времени не составляет 100%.

Ложным результатам сильно способствует процедура отбора проб. Наиболее точным образцом для лабораторной диагностики COVID-19 является мокрота нижних дыхательных путей (лаваж).

Мазки из зева не рекомендуются для диагностики, потому что на слизистой верхних дыхательных путей вирус не задерживается, а транзитом спускается глубже. Это подтверждено многочисленными исследованиями и является частой причиной ложноотрицательных результатов. Т.е. тест истинно отрицательный, т.к. вируса уже нет в ВДП, а человек инфицирован. Причем доля таких результатов может быть от 30 до 60%.

Т.е. отрицательный результат не исключает заражения COVID-19 и не может быть единственной причиной для принятия решений о лечении или ведении пациента.

Ложноположительные результаты

Доля ложноположительных результатов ПЦР диагностики по оценкам ученых может достигать 30-40%. На первом месте среди причин ложных тестов ошибки при заборе, транспортировке и хранении проб. Не квалифицированный персонал часто допускает ошибки при заборе и помещении пробы в контейнер. Происходит контаминация и в пробу заносится посторонний инфицированный материал.

Второе место занимают причины, связанные с качеством анализа. В идеале анализ проводится в лаборатории, в специальном помещении и квалифицированным персоналом. Для исключения смешивания проб, при случайном разлитии биоматериала с положительной пробой проводят полную дезинфекцию помещения, иногда несколько раз подряд. Если этого не сделать, из-за высокой чувствительности теста все остальные пробы становятся положительными.

Из-за огромного количества обследуемых проб анализы проводятся не только в подготовленных лабораториях, но и в обычных поликлиниках. Рассчитывать на лабораторные условия в районной поликлинике не приходится.

При всех этих недостатках, ПЦР-тест является одним из самых точных методов скрининговых исследований. При соблюдении простых правил работы с пробами точность метода может достигать 100%, но на практике так пока не получается.

Где можно сдать мазок на ковид

Если у Вас нет симптомов, самостоятельно сдавать мазок на ковид не имеет смысла. В случае ложноположительного результата Вы испытаете на себе беспощадность системы здравоохранения и прелести самоизоляции.

Если есть такая необходимость, самостоятельно сдать тест на ковид можно в лабораториях, которые официально допущены Роспотребнадзором.

Если у Вас есть симптомы коронавируса или ОРВИ, необходимо вызвать врача на дом. Врач определит необходимость проведения тестирования и организует взятие мазка на коронавирус. Для отбора проб к Вам домой приедет специальная бригада медиков, а результат сообщит врач из поликлиники. Мазки, также, должны взять у проживающих с Вами людей.

Как подготовиться к сдаче ПЦР теста

Важно понимать, что точность результата анализа на ковид методом ПЦР зависит от множества параметров. В каждом цикле цепной реакции чувствительность может быть разная. ПЦР определяет не наличие или отсутствие ДНК коронавируса, а количество этой ДНК в отобранных пробах. Если за разумное количество циклов ДНК не определена, тест будет отрицательным. Если на последних циклах есть амплификация, но она ниже, установленного для положительного результата порога, то результат теста также будет отрицательным.

Для объективного результата, перед отбором проб, нужно соблюсти следующие условия.

• не полоскать горло непосредственно перед взятием мазка
• не пить за 2-3 часа
• не орошать зев менее чем за 2 суток до взятия проб
• за 10-14 дней до взятия мазка на ковид перестать капать гриппферон и не принимать другие интерфероны

При несоблюдении этих условий в пробу могут попасть посторонние биоматериалы и диагностика будет некачественной.