Подробно о коронавирусе
В декабре 2019 года в Китае была выявлена серия случаев пневмонии, вызванной неизвестным вирусом. Этот новый коронавирус имеет разные названия: 2019-нКоВ и SARS-CoV-2. Власти Китая официально объявили новый коронавирус возбудителем этих инфекций.
Coronaviridae, отряд Nidovirales
Коронавирусы представляют собой несегментированные вирусы с позитивной смысловой РНК-оболочкой, которые принадлежат к семейству Coronaviridae и отряду Nidovirales и широко распространены у людей и других млекопитающих, вызывая множественные состояния, начиная от «обычного» гриппа и заканчивая летальными случаями.
По данным ВОЗ данная болезнь классифицируется как глобальная чрезвычайная ситуация в области общественного здравоохранения.
Коронавирусы можно разделить на 4 рода: альфа, бета, дельта и гамма, из которых альфа- и бета- коронавирусы, как известно, до сих пор заражают людей, вызывая заболевания от простуды до более тяжелых состояний, таких как респираторный синдром на Ближнем Востоке (MERS-CoV) и респираторный синдром (SARS-CoV), который стал причиной тысяч смертей в 2002 году. Вирусы HCoV 229Х, NL63, OC43 и HKU1 являются эндемичными по всему миру.
Конструктивно коронавирусы представляют собой сферические или плеоморфные вирусы, диаметр которых варьируется от 80 до 120 нм. Различные анализы электронной микроскопии идентифицировали поверхности вириона говорят о том, что они представляют собой структуры, организованные проекциями, которые, в свою очередь, состоят из тримеров вирусного гликопротеина S (Spike). Кроме того, были выявлены другие короткие проекции, образованные димерами белков HE (гемагглютининовой эстеразы), что наблюдалось у некоторых бета-коронавирусов.
Между тем, оболочка вируса усиливается за счет мембранного гликопротеина (M) (наиболее распространенного на поверхности вириона), который встроен в мембрану трансмембранных доменов. Другим структурным компонентом вириона является белок Envelope (E). Это белок небольшого размера, который обладает высокой гидрофобностью и обнаруживается в меньшей пропорции, чем остальные белки. Вирусные белки коронавирусов внедряются в липидную мембрану, которая происходит из зараженной клетки. Внутри вирусная частица состоит из дополнительного белка, известного как нуклеопротеин (N), который связывается с вирусной РНК в виде нитевидной спиральной структуры, тем самым защищая РНК от деградации.
Геном коронавируса представляет собой несегментированную одноцепочечную РНК с положительной полярностью (+ ssRNA) размером от 27 до 32 килобаз. Геномная РНК проявляет полиаденилирование модефикации белка вируса. В этой РНК есть несколько открытых рамок считывания (6-11 ORF). Первая ORF кодирует приблизительно 16 неструктурных белков, тогда как остальные ORF кодируют дополнительные и неструктурные белки.
Анализ последовательностей генома 2019-nCoV по сравнению с SARS-CoV довольно похож, однако существуют определенные различия, такие как отсутствие кодирующей области для белка 8a в 2019-nCoV, поэтому он может иметь влияние на меньший патогенез по сравнению с SARS-CoV14.